A Csillagkapu című filmben Jack O'Neill felesége Sarah O'Neill. A férfi depressziós időszakot élt át, mert fia lelőtte magát apja pisztolyával. Amikor Dr. Daniel Jackson megfejtette a Csillagkapu írásjegyeit, az ezredest visszahívták szolgálatba, és ő vezette a felderítő csapatot és Jacksont a kapu túloldalára, az Abydos nevű bolygóra. O'Neill parancsa úgy szólt, hogy robbantson fel egy nukleáris töltetet a kapu közelében bármiféle veszély észlelése esetén, ám egy abydos-i fiú, Skaara újra értelmet adott életének. Ré legyőzése után O'Neill és csapata visszatért a Földre, Daniel pedig a bolygón maradt az ott megismert és később feleségül vett nő mellett.
A Csillagkapu sorozatban a goa'uld Apophisz váratlan behatolása után létrehozták a Csillagkapu Parancsnokságot .Az Istenek gyermekei című bevezető epizódban, O'Neill lett a CSK-1 vezetője. Ekkor már nem házas. A 2. évadban Az ötödik faj című részben Jacket megragadja egy idegen gépezet és az elméjébe egy idegen faj tudását tölti bele, ennek segítségével ő az első ember, aki egy másik galaxisba, az Asgardok otthonába utazik. A 7. évad végén újra ilyen "letöltésen" esik át, tudásával elvezeti a CSK-1-et az Ősök antarktiszi bázisára. O'Neill birtokolja az ősi gént, melynek segítségével irányítani képes az Ősök fegyverét, a széket, mellyel megmenti a Földet Anubis seregétől. Mivel a hatalmas ősi tudás elpusztítaná az elméjét és megölné őt, sztázisba helyezik az ősi bázison, míg a 8. évad elején Thor eltávolítja a tudást és megmenti ezzel. Kiderül, hogy O'Neill különösen fejlett egyede az emberi fajnak, Thor szerint ő egy előrelépése az emberiség fejlődésének, de nem eléggé, hogy segítsen az asgardoknak megoldani a saját klónozási problémájukat. Mindazonáltal beletesznek egy jelzést az ezredes DNS-ébe, hogy megakadályozzanak bármiféle vele végzett genetikai kísérletet. A 8. évad elején O'Neill-t tábornokká léptetik elő és átveszi a Csillagkapu Parancsnokság vezetését. A 9. évad elején ismét előléptetik, ezúttal a Föld Védelmi Szervezetének élére, a CSKP élére Hank Landry tábornok kerül, O'Neill ezután mindössze két részben tűnik fel ebben az évadban. Az utolsó, 10. évadban megjelenik ismét két részben, majd négy részében a Csillagkapu Atlantisznak. Szerepet kapott a csak DVD-re megjelent Stargate: Continuum című filmben is. A nyitójelenetek közben megölik, de a film során feltűnik egy másik idővonalbeli O'Neill-ként.
O'Neill:
|